Έχεις δίκιο. Η ενδεδειγμένη μέθοδος που προτείνεται στο handbook του Drupal είναι να γίνεται ένα πλήρες backup όλων των αρχείων (πυρήνας+default+all) πριν από κάθε αναβάθμιση, είτε πρόκειται για μονάδα είτε για τον πυρήνα.

Πρακτικά έχω την εντύπωση ότι όταν αναβαθμίζουμε μια μονάδα, τα νέα αρχεία θα αντικαταστήσουν τα παλιά μόνο της μονάδας και δεν θα πειράξουν καθόλου τους υπόλοιπους φακέλους και ειδικά τα δικά μας αρχεία. Οπότε αν κάτι πάει στραβά, το πολύ πολύ να χρειαστεί να διαγράψουμε να νέα αρχεία της μονάδας και να ανεβάσουμε ξανα την παλαιότερη έκδοση την οποία μπορούμε να βρούμε στο site του Drupal και να γυρίσουμε την βάση στην προηγούμενη κατάσταση που αποθηκεύσαμε.

Σε κάθε περίπτωση θα διορθώσω το βίντεο ώστε να ακολουθεί τις ενδεδειγμένες προτάσεις. Ευχαριστώ για το σχόλιο.